1、專(zhuān)利復(fù)審中的客體問(wèn)題。一方面，專(zhuān)利申請(qǐng)被駁回后僅能選擇復(fù)審這一種救濟(jì)措施，而不能直接向法院起訴或者請(qǐng)求行政復(fù)議。另一方面，專(zhuān)利申請(qǐng)駁回決定之外的其他具體行政行為不能選擇復(fù)審，只能選擇向法院起訴或者請(qǐng)求行政復(fù)議。
2、專(zhuān)利復(fù)審程序中的延期問(wèn)題。專(zhuān)利復(fù)審請(qǐng)求經(jīng)過(guò)合議審查后，專(zhuān)利復(fù)審委會(huì)發(fā)出兩類(lèi)通知書(shū)，主要包括：一是較常見(jiàn)的復(fù)審?fù)ㄖ獣?shū)，二是較少見(jiàn)的復(fù)審請(qǐng)求口頭審理通知書(shū)，并指定答復(fù)期限1個(gè)月。
3、專(zhuān)利復(fù)審程序中的權(quán)利恢復(fù)問(wèn)題。專(zhuān)利復(fù)審程序中涉及權(quán)利需要恢復(fù)的情形主要包括兩種：一是因正當(dāng)理由延誤了提起復(fù)審的期限，導(dǎo)致復(fù)審請(qǐng)求權(quán)的喪失;二是因正當(dāng)理由延誤了答復(fù)復(fù)審?fù)ㄖ獣?shū)的指定期限，導(dǎo)致專(zhuān)利申請(qǐng)權(quán)的喪失。這兩種情形在具體辦理權(quán)利恢復(fù)時(shí)存在差別。

國(guó)務(wù)院專(zhuān)利行政部門(mén)對(duì)發(fā)明專(zhuān)利申請(qǐng)進(jìn)行實(shí)質(zhì)審查后，認(rèn)為不符合本法規(guī)定的，應(yīng)當(dāng)通知申請(qǐng)人，要求其在指定的期限內(nèi)陳述意見(jiàn)，或者對(duì)其申請(qǐng)進(jìn)行修改。答復(fù)審查意見(jiàn)通知書(shū)的意見(jiàn)陳述書(shū)，應(yīng)當(dāng)避免僅引用專(zhuān)利法及其實(shí)施細(xì)則的相關(guān)法律規(guī)定、而缺少針對(duì)性的答復(fù)意見(jiàn)。

申請(qǐng)人在答復(fù)審查意見(jiàn)通知書(shū)時(shí)，首先要核實(shí)其中引用的對(duì)比文件，在此過(guò)程中找出存疑點(diǎn)，在質(zhì)疑對(duì)比文件的事實(shí)認(rèn)定、公知常識(shí)認(rèn)定、對(duì)比文件的結(jié)合啟示時(shí)，要從技術(shù)領(lǐng)域、技術(shù)方案、技術(shù)問(wèn)題以及技術(shù)效果等角度結(jié)合實(shí)際案情在意見(jiàn)陳述書(shū)中進(jìn)行有理有據(jù)地陳述。

專(zhuān)利局決定受理的異議案，應(yīng)將異議書(shū)副本送交申請(qǐng)人，申請(qǐng)人應(yīng)在收到異議書(shū)副本之日起3個(gè)月內(nèi)就異議作出答復(fù)。無(wú)正當(dāng)理由逾期不作答復(fù)的，專(zhuān)利申請(qǐng)視為撤回。專(zhuān)利局在異議審查階段，要依法對(duì)異議是否成立進(jìn)行審查。如認(rèn)為異議成立，即可作出駁回申請(qǐng)的決定。如果認(rèn)為異議不成立，或者在異議審查期間無(wú)人提出異議的，則作出授予專(zhuān)利權(quán)的決定。

申請(qǐng)人對(duì)駁回決定不服的，可以在收到通知之日起3個(gè)月內(nèi)，向?qū)＠麖?fù)審委員會(huì)提出復(fù)審申請(qǐng)。異議人對(duì)授權(quán)決定不服的，不能立即請(qǐng)求復(fù)審，只能在專(zhuān)利權(quán)取得以后，向?qū)＠麖?fù)審委員會(huì)請(qǐng)求宣告該項(xiàng)專(zhuān)利權(quán)無(wú)效。

根據(jù)《專(zhuān)利法》第四十五條的規(guī)定，自國(guó)務(wù)院專(zhuān)利行政部門(mén)公告授予專(zhuān)利權(quán)之日起，任何單位或者個(gè)人認(rèn)為該專(zhuān)利權(quán)的授予不符合本法有關(guān)規(guī)定的，可以請(qǐng)求專(zhuān)利復(fù)審委員會(huì)宣告該專(zhuān)利權(quán)無(wú)效。